Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACE1Q8IYU2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACE1Q8IYU2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms