Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG1Q86XK7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSIG1Q86XK7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms