Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX20Q7Z614 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX20Q7Z614 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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