Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT27Q7Z3Y8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT27Q7Z3Y8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms