Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG9AQ7Z3C6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATG9AQ7Z3C6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms