Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP50Q70EL3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP50Q70EL3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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