Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX8Q6ZV50 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms