Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC55Q6ZSA7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms