Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFXL1Q6ZNB6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms