Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN84

CCDC81, Coiled-coil domain-containing protein 81, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC81Q6ZN84 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC81Q6ZN84 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC81Q6ZN84 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms