Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRRC8BQ6P9F7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC8BQ6P9F7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms