Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTC41PQ6P2S7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC41PQ6P2S7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC41PQ6P2S7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms