Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGMBQ6NW40 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms