Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPPQ6IPU0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms