Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
CARMIL2Q6F5E8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CARMIL2Q6F5E8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL2Q6F5E8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms