Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms