Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
L1TD1Q5T7N2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms