Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LDLRAD1Q5T700 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LDLRAD1Q5T700 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LDLRAD1Q5T700 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms