Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC183Q5T5S1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms