Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRAPPC3LQ5T215 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms