Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM201Q5SNT2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM201Q5SNT2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms