Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC6Q5RKV6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC6Q5RKV6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC6Q5RKV6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC6Q5RKV6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC6Q5RKV6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC6Q5RKV6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC6Q5RKV6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC6Q5RKV6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 444.3 ms