Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAPPA-AS1Q5QFB9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms