Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PITRM1Q5JRX3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITRM1Q5JRX3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms