Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR3Q5GH77 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR3Q5GH77 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR3Q5GH77 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms