Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D3Q587I9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D3Q587I9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms