Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF394Q53GI3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF394Q53GI3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms