Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCBP3Q53F19 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCBP3Q53F19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms