Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF260Q3ZCT1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF260Q3ZCT1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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