Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N2

LGALS9B, Galectin-9B, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9BQ3B8N2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9BQ3B8N2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms