Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSR1Q2NL82 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSR1Q2NL82 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms