Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GEN1Q17RS7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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