Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LONRF1Q17RB8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LONRF1Q17RB8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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