Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYPL1Q16563 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYPL1Q16563 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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