Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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