Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPE65Q16518 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPE65Q16518 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms