Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSX1Q16384 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms