Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
VPS72Q15906 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS72Q15906 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS72Q15906 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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