Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN9AQ15858 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN9AQ15858 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
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