Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB3Q15768 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB3Q15768 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB3Q15768 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB3Q15768 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB3Q15768 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB3Q15768 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB3Q15768 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB3Q15768 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB3Q15768 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNB3Q15768 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNB3Q15768 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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