Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLR1Q15399 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLR1Q15399 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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