Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK3Q15120 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK3Q15120 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms