Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KARSQ15046 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KARSQ15046 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KARSQ15046 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KARSQ15046 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KARSQ15046 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KARSQ15046 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KARSQ15046 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KARSQ15046 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KARSQ15046 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KARSQ15046 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KARSQ15046 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KARSQ15046 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KARSQ15046 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KARSQ15046 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KARSQ15046 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KARSQ15046 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KARSQ15046 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KARSQ15046 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KARSQ15046 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KARSQ15046 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KARSQ15046 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KARSQ15046 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KARSQ15046 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KARSQ15046 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KARSQ15046 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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