Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSME4Q14997 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME4Q14997 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
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