Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3AQ14563 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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