Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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