Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VGLL4Q14135 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VGLL4Q14135 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VGLL4Q14135 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms