Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP1Q13835 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP1Q13835 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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