Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOFQ13790 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOFQ13790 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOFQ13790 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOFQ13790 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOFQ13790 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOFQ13790 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOFQ13790 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOFQ13790 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOFQ13790 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOFQ13790 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOFQ13790 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOFQ13790 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOFQ13790 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOFQ13790 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APOFQ13790 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOFQ13790 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOFQ13790 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOFQ13790 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOFQ13790 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOFQ13790 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOFQ13790 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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