Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB3Q13509 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB3Q13509 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB3Q13509 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms